Оценка частот генетического варианта LCT rs4988235 (-13910 c > t), связанного с непереносимостью лактозы, в Российской Федерации
И.С. Колесникова, Н.С. Широкова, В.С. Кушнаренко, Н.В. Пантелеева, А.А. Мамчиц, А.С. Межевалова, В.В. Полуновский
Национальный центр генетических исследований, Российская Федерация, 630090, г. Новосибирск, ул. Николаева, 12
Непереносимость лактозы является фактором риска целого ряда сопутствующих нарушений здоровья. Понимание генетической предрасположенности к непереносимости лактозы позволяет выбрать корректные схемы лечения и профилактики заболеваний. Вместе с тем в Российской Федерации (РФ) до недавнего времени исследования в данной сфере в основном ограничивались локальными популяциями либо были небольшими частями общемировых исследований, что затрудняет комплексную оценку по России в целом. Также ранее не проводили сравнения с аналогичными частотами встречаемости этого варианта для стран постсоветского пространства.
Осуществлен анализ частоты варианта регуляторного региона гена LCT rs4988235, связанного с непереносимостью лактозы, в различных регионах РФ и в некоторых соседних странах.
Материалом служил буккальный эпителий 40 111 обследуемых. Генотипирование проводили с помощью полимеразной цепной реакции в реальном времени с гибридизационно-флуоресцентной детекцией сигналов.
Частота аллеля С, ассоциированного с непереносимостью лактозы, в РФ составила в среднем 67,73 ± 0,03 %. Распространенность генотипа СС в среднем в России составила 46,1 %, CT – 34,22 %, ТТ – 10,66 %, что значимо отличалось от частот в европейских и азиатских популяциях. Максимальная частота аллеля С обнаружена в Якутии (84,0 ± 0,6 %), минимальная (54,4 ± 0,7 %) – во Владимирской области. Выявлена достоверная умеренная корреляция распространенности аллеля Т и доли восточнославянского населения в субъекте РФ. Частота аллеля С в Беларуси и на Украине составила 67,8 ± 0,4 и 68,7 ± 0,3 % соответственно, что сопоставимо с аналогичным показателем для РФ; в Армении (86,4 ± 1,3 %), Грузии (87,3 ± 1,0 %), Казахстане (82,1 ± 0,1 %), Кыргызстане (81,9 ± 0,6 %) и Узбекистане (86,4 ± 0,7 %) – выше, чем в Российской Федерации.
На обширной общероссийской выборке получены данные о распределении генотипов rs4988235 по регионам РФ и в соседних государствах. Обнаруженные сходства и различия, очевидно, связаны со сходствами и различиями этнического состава регионов РФ и соседних государств.
- Lactose Intolerance and Its Dietary Management: An Update / G.K. Katoch, N. Nain, S. Kaur, P. Rasane // J. Am. Nutr. Assoc. – 2022. – Vol. 41, № 4. – P. 424–434. DOI: 10.1080/07315724.2021.1891587
- Lactose intolerance in adults: biological mechanism and dietary management / Y. Deng, B. Misselwitz, N. Dai, M. Fox // Nutrients. – 2015. – Vol. 7, № 9. – P. 8020–8035. DOI: 10.3390/nu7095380
- Ugidos-Rodrigues S., Malanta-Gonzalaz M.C., Sanches-Mata M.C. Lactose malabsorption and intolerance: a review // Food Funct. – 2018. – Vol. 9, № 8. – P. 4056–4068. DOI: 10.1039/c8fo00555a
- Storhaug C.L., Fosse S.K., Fadnes L.T. Country, regional, and global estimates for lactose malabsorption in adults: a systematic review and meta-analysis // Lancet Gastroenterol. Hepatol. – 2017. – Vol. 2, № 10. – P. 738–746. DOI: 10.1016/S2468-1253(17)30154-1
- Ileal Lactase Expression Associates with Lactase Persistence Genotypes / J.K. Nowak, E. Dybska, M. Dworacka, N. Tsikhan, V. Kononets, S. Bermagambetova, J. Walkowiak // Nutrients. – 2021. – Vol. 13, № 4. – P. 1340. DOI: 10.3390/nu13041340
- Porzi M., Burton-Pimentel K.J., Walther B., Vergères G. Development of Personalized Nutrition: Applications in Lactose Intolerance Diagnosis and Management // Nutrients. – 2021. – Vol. 13, № 5. – P. 1503. DOI: 10.3390/nu13051503
- Козлов А.И. Полиморфизм генетических детерминант минерального обмена в кости в различных группах коми // Вестник археологии, антропологии и этнографии. – 2021. – № 4 (55). – C. 151–161. DOI: 10.20874/2071-0437-2021-55-4-12
- Своеобразие субэтнических групп ненцев по генетическим детерминантам метаболизма сахарозы, трегалозы и лактозы / А.И. Козлов, М.Б. Лавряшина, Г.Г. Вершубская, Е.В. Балановская // Вестник Московского университета. Серия 23: Антропология. – 2022. – № 3. – С. 63–71. DOI: 10.32521/2074-8132.2022.3.063-071
- High prevalence of lactase non-persistence among indigenous nomadic Nenets, north-west Russia / Y. Khabarova, V. Grigoryeva, S. Tuomisto, P. Karhunen, K. Mattila, M. Isokoski // Int. J. Circumpolar Health. – 2012. – Vol. 71. – P. 1–6. DOI: 10.3402/ijch.v71i0.17898
- Prevalence of lactase persistent / non-persistent genotypes and milk consumption in a young population in north-west Russia / Y. Khabarova, S.-T. Torniainen, H.-A. Nurmi, I.-E. Järvelä, M.-K. Isokoski, K.-J. Mattila // World J. Gastroenterol. – 2009. – Vol. 15, № 15. – P. 1849–1853. DOI: 10.3748/wjg.15.1849
- Evidence of still-ongoing convergence evolution of the lactase persistence T-13910 alleles in humans / N.S. Enattah, A. Trudeau, V. Pimenoff, L. Maiuri, S. Auricchio, L. Greco, M. Rossi, M. Lentze [et al.] // Am. J. Hum. Genet. – 2007. – Vol. 81, № 3. – P. 615–625. DOI: 10.1086/520705
- Genetic signatures of strong recent positive selection at the lactase gene / T. Bersaglieri, P.C. Sabeti, N. Patterson, T. Vanderploeg, S.F. Schaffner, J.A. Drake, M. Rhodes, D.E. Reich, J.N. Hirschhorn // Am. J. Hum. Genet. – 2004. – Vol. 74, № 6. – P. 1111–1120. DOI: 10.1086/421051
- World-wide distributions of lactase persistence alleles and the complex effects of recombination and selection / A. Liebert, S. López, B.L. Jones, N. Montalva, P. Gerbault, W. Lau, M.G. Thomas, N. Bradman [et al.] // Hum. Genet. – 2017. – Vol. 136, № 11–12. – P. 1445–1453. DOI: 10.1007/s00439-017-1847-y
- Lactase deficiency in Russia: multiethnic genetic study / E. Kovalenko, E. Vergasova, O. Shoshina, I. Popov, A. Ilinskaya, A. Kim, N. Plotnikov, I. Barenbaum [et al.] // Eur. J. Clin. Nutr. – 2023. – Vol. 77, № 8. – P. 803–810. DOI: 10.1038/s41430-023-01294-8
- Lactase persistence in central Asia: phenotype, genotype, and evolution / E. Heyer, L. Brazier, L. Ségurel, T. Hegay, F. Austerlitz, L. Quintana-Murci, M. Georges, P. Pasquet, M. Veuille // Hum. Biol. – 2011. – Vol. 83, № 3. – P. 379–392. DOI: 10.3378/027.083.0304
- Very low frequency of the lactase persistence allele LCT-13910T in the Armenian population / S. Németh, G. Kriegshäuser, K. Hovhannesyan, H. Hayrapetyan, C. Oberkanins, T. Sarkisian // Ann. Hum. Biol. – 2022. – Vol. 49, № 5–6. – P. 260–262. DOI: 10.1080/03014460.2022.2126887
- Accuracy of a Genetic Test for the Diagnosis of Hypolactasia in Chilean Children: Comparison With the Breath Test / F. Alliende, C. Vial, K. Espinoza, D. Schnettle, V. Romero, I. Miquel, M.E. Arancibia, G. Rios [et al.] // J. Pediatr. Gastroenterol. Nutr. – 2016. – Vol. 63, № 1. – P. e10–e13. DOI: 10.1097/MPG.0000000000001208
- 13910C > T and 22018G > A LCT gene polymorphisms in diagnosing hypolactasia in children / J. Tomczonek-Morus, A. Wojtasik, K. Zeman, B. Smolarz, L. Bąk-Romaniszyn // United European Gastroenterol. J. – 2019. – Vol. 7, № 2. – P. 210–216. DOI: 10.1177/2050640618814136
- Ridefelt P., Håkansson L.D. Lactose intolerance: lactose tolerance test versus genotyping // Scand. J. Gastroenterol. – 2005. – Vol. 40, № 7. – P. 822–826. DOI: 10.1080/00365520510015764
- A worldwide correlation of lactase persistence phenotype and genotypes / Y. Itan, B.L. Jones, C.J. Ingram, D.M. Swal-low, M.J. Thomas // BMC Evol. Biol. – 2010. – Vol. 10. – P. 36. DOI: 10.1186/1471-2148-10-36
- Low Prevalence of Lactase Persistence in Bronze Age Europe Indicates Ongoing Strong Selection over the Last 3,000 Years / J. Burger, V. Link, J. Blöcher, A. Schulz, C. Sell, Z. Pochon, Y. Diekmann, A. Žegarac [et al.] // Curr. Biol. – 2020. – Vol. 30, № 21. – P. 4307–4315.e13. DOI: 10.1016/j.cub.2020.08.033
- Dairying, diseases and the evolution of lactase persistence in Europe / R.P. Evershed, G. Davey Smith, M. Roffet-Salque, A. Timpson, Y. Diekmann, M.S. Lyon, L.J.E. Cramp, E. Casanova [et al.] // Nature. – 2022. – Vol. 608, № 7922. – P. 336–345. DOI: 10.1038/s41586-022-05010-7
- Ségurel L., Bon C. On the Evolution of Lactase Persistence in Humans // Annu. Rev. Genomics Hum. Genet. – 2017. – Vol. 18. – P. 297–319. DOI: 10.1146/annurev-genom-091416-035340
- The T/G-13915 variant upstream of the lactase is the founder allele of lactase (LCT) gene persistence in an urban Saudi population / F. Imtiaz, E. Savilahti, A. Sarnesto, D. Trabzuni, K. Al-Kahtani, I. Kagevi, M.S. Rashed, B.F. Meyer, I. Järvelä // J. Med. Genet. – 2007. – Vol. 44, № 10. – P. e89. DOI: 10.1136/jmg.2007.051631
- Effects of Prebiotic and Probiotic Supplementation on Lactase Deficiency and Lactose Intolerance: A Systematic Review of Controlled Trials / R. Leis, M.J. de Castro, C. de Lamas, R. Picáns, M.L. Couce // Nutrients. – 2020. – Vol. 12, № 5. – P. 1487. DOI: 10.3390/nu12051487
- Prebiotic Strategies to Manage Lactose Intolerance Symptoms / G. Angima, Y. Qu, S.H. Park, D.C. Dallas // Nutrients. – 2024. – Vol. 16, № 7. – P. 1002. DOI: 10.3390/nu16071002
- Lactose Intolerance versus Cow's Milk Allergy in Infants: A Clinical Dilemma / A. Darma, K.R. Sumitro, J. Jo, N. Si-torus // Nutrients. – 2024. – Vol. 16, № 3. – P. 414. DOI: 10.3390/nu16030414