Мультирезистентные к антибиотикам штаммы и гены вирулентности salmonella strains, выделенной из мяса кур (Ханой, Вьетнам)

Файл статьи: 
Иконка PDF health-risk-analysis-2023-1-11.pdf
УДК: 
614:31
DOI: 
10.21668/health.risk/2023.1.11
Авторы: 

Да Ксуан Фам1, Хао Ле Ти Хонг2, Хуен Тран Ти Тан3, Лонг Тхан Ле2, Хао Вин Ле2, Хан Нин Ти2, Минь Ле Тран4, Нгуен Тан Трунг2

Организация: 

1Вьетнамский национальный университет, Вьетнам, г. Хошимин
2Национальный институт контроля пищевых продуктов, Вьетнам, г. Ханой, Фам Тан Дуат-Стрит, 65
3Исследовательский институт стволовых клеток и генных технологий Vinmec, Вьетнам, г. Ханой
4Специализированная средняя школа для одаренных студентов Ханойского университета науки,
Вьетнам, г. Ханой, ул. Луонг Винь, 182

Аннотация: 

Salmonella enterica является одним из опасных пищевых патогенов (список Всемирной организации здраво-охранения (ВОЗ)). Во Вьетнаме продукция птицеводства является одним из наиболее широко распространённых мясных продуктов и основным источником S. enterica.
Изучены мультирезистентные штаммы Salmonella, определены чувствительность к антибиотикам с ис-пользованием 15 разных типов препаратов и осуществлено последующее секвенирование для анализа генов устойчивости к антибиотикам, генотипов, типирования на основе мультилокусных последовательностей (MLST) и анализа плазмид.
Результаты тестов на чувствительность к антибиотикам показали фенотипическую устойчивость к 9–11 типам антимикробных препаратов у всех изученных штаммов. Определены 43 гена в шести секвенированных штаммах, которые были связаны с устойчивостью к антибиотикам: штаммы, носящие спектр генов, связанных с аминогликозидной устойчивостью (aac (3), aac (6), ant (3), aph (3), aph (6), aadA); все штаммы с генами blaCTX-M-55 или blaCTX-M-65, которые устойчивы к антибиотикам третьего поколения; часто в секвенированных изолятах также обнаруживались гены sul1, sul2, sul3, tet (A), qnrS1, floR, dfrA14 или dfrA27.
Помимо этого, геномное секвенирование показало, что все штаммы содержали острова патогенности SPI 1, SPI 2, SPI 3, создавая таким образом большое количество потенциальных триггеров заболевания. В некоторых штаммах были обнаружены C63PI, SPI 9, SPI 13, SPI 14 и плазмиды, такие как Col156, IncHI2, IncHI2A, IncFIB, Col (MGD2).

Ключевые слова: 
антимикробные препараты, Salmonella, мультирезистентность, фактор вирулентности, плазмида, куриное мясо, ген устойчивости к антибиотикам, остров патогенности (ОП), бета-лактам
Мультирезистентные к антибиотикам штаммы и гены вирулентности Salmonella Strains, выделенной из мяса кур (Ханой, Вьетнам) / Ксуан Да Фам, Хао Ле Ти Хонг, Хуен Тран Ти Тан, Лонг Тхан Ле, Хао Вин Ле, Нин Хан Ти, Минь Ле Тран, Нгуен Тан Трунг // Анализ риска здоровью. – 2023. – № 1. – С. 115–123. DOI: 10.21668/health.risk/2023.1.11
Список литературы: 
  1. A comprehensive review of non-enterica subspecies of Salmonella enterica / A. Lamas, J.M. Miranda, P. Regal, B. Vázquez [et al.] // Microbiol. Res. – 2018. – Vol. 206. – P. 60–73. DOI: 10.1016/J.MICRES.2017.09.010
  2. Risk assessments of Salmonella in eggs and broiler chickens [Электронный ресурс] // FAO, WHO. – 2002. – 302 p. – URL: https://apps.who.int/iris/handle/10665/342257 (дата обращения: 18.10.2022).
  3. Tracing Origins of the Salmonella Bareilly Strain Causing a Food-borne Outbreak in the United States / M. Hoffmann, Y. Luo, S.R. Monday, N. Gonzalez-Escalona [et al.] // J. Infect. Dis. – 2016. – Vol. 213. – P. 502–508. DOI: 10.1093/INFDIS/JIV297
  4. Antimicrobial susceptibility of Salmonella spp.isolated from raw meats at traditional markets in Ho Chi Minh city / H.A.V. Truong, H.K.T. Nguyen, V.H. Chu, Y.H. Huynh // Ministry of Science and Technology. – 2021. – Vol. 63. – P. 55–59. DOI: 10.31276/VJST.63(8).55-59
  5. Prevalence and antibiotic resistance of Salmonella isolated from poultry and its environment in the Mekong Delta, Vi-etnam / T.K. Nguyen, L.T. Nguyen, T.T.H. Chau, T.T. Nguyen [et al.] // Vet. World. – 2021. – Vol. 14. – P. 3216–3223. DOI: 10.14202/VETWORLD.2021.3216-3223
  6. Differential Single Nucleotide Polymorphism-Based Analysis of an Outbreak Caused by Salmonella enterica Serovar Manhattan Reveals Epidemiological Details Missed by Standard Pulsed-Field Gel Electrophoresis / E. Scaltriti, D. Sassera, F. Comandatore, C.M. Morganti [et al.] // J. Clin. Microbiol. – 2015. – Vol. 53. – P. 1227. DOI: 10.1128/JCM.02930-14
  7. Multilocus sequence typing as a replacement for serotyping in Salmonella enterica / M. Achtman, J. Wain, F.X. Weill, S. Nair [et al.] // PLoS Pathog. – 2012. – Vol. 8. DOI: 10.1371/JOURNAL.PPAT.1002776
  8. Whole-Genome Sequencing in Outbreak Analysis / C.A. Gilchrist, S.D. Turner, M.F. Riley, W.A. Petri, E.L. Hewlett // Clin. Microbiol. Rev. – 2015. – Vol. 28. – P. 541–563. DOI: 10.1128/CMR.00075-13
  9. Evaluation of whole genome sequencing for outbreak detection of salmonella enterica / P. Leekitcharoenphon, E.M. Nielsen, R.S. Kaas, O. Lund, F.M. Aarestrup // PLoS One. – 2014. – Vol. 9. DOI: 10.1371/journal.pone.0087991
  10. The salmonella in silico typing resource (SISTR): An open web-accessible tool for rapidly typing and subtyping draft salmonella genome assemblies / C.E. Yoshida, P. Kruczkiewicz, C.R. Laing, E.J. Lingohr [et al.] // PLoS One. – 2016. – Vol. 11. DOI: 10.1371/journal.pone.0147101
  11. Seemann T. ABRicate: mass screening of contigs for antiobiotic resistance genes [Электронный ресурс]. – URL: https://github.com/tseemann/abricate (дата обращения: 16.10.2022).
  12. Identification of acquired antimicrobial resistance genes / E. Zankari, H. Hasman, S. Cosentino, M. Vestergaard [et al.] // J. Antimicrob. Chemother. – 2012. – Vol. 67. – P. 2640–2644. DOI: 10.1093/JAC/DKS261
  13. The Comprehensive Antibiotic Resistance Database / A.G. McArthur, N. Waglechner, F. Nizam, A. Yan [et al.] // Antimicrob. Agents Chemother. – 2013. – Vol. 57. – P. 3348. DOI: 10.1128/AAC.00419-13
  14. ARG-ANNOT, a new bioinformatic tool to discover antibiotic resistance genes in bacterial genomes / S.K. Gupta, B.R. Padmanabhan, S.M. Diene, R. Lopez-Rojas [et al.] // Antimicrob. Agents Chemother. – 2014. – Vol. 58. – P. 212–220. DOI: 10.1128/AAC.01310-13
  15. In Silico detection and typing of plasmids using plasmidfinder and plasmid multilocus sequence typing / A. Carattoli, E. Zankari, A. Garciá-Fernández, M.V. Larsen [et al.] // Antimicrob. Agents Chemother. – 2014. – Vol. 58. – P. 3895–3903. DOI: 10.1128/AAC.02412-14
  16. Antibiotic resistance in Salmonella spp. isolated from poultry: A global overview / R.E. Castro-Vargas, M.P. Herrera-Sánchez, R. Rodríguez-Hernández, I.S. Rondón-Barragán // Vet. World. – 2020. – Vol. 13. – P. 2070–2084. DOI: 10.14202/VETWORLD.2020.2070-2084
  17. Genome sequences of multidrug-resistant Salmonella enterica serovar Paratyphi B (dT+) and Heidelberg strains from the Colombian poultry chain / P. Donado-Godoy, J.F. Bernal, F. Rodríguez, Y. Gomez [et al.] // Genome Announc. – 2015. – Vol. 3. DOI: 10.1128/genomeA.01265-15
  18. Abundance of colistin-resistant Escherichia coli harbouring mcr-1 and extended-spectrum β-lactamase-producing E. coli co-harbouring blaCTX-M-55 or -65 with blaTEM isolates from chicken meat in Vietnam / T. Nakayama, H. le Thi, P.N. Thanh, D.T.N. Minh [et al.] // Archives of Microbiology. – 2022. – Vol. 204. – P. 137. DOI: 10.1007/S00203-021-02746-0
Получена: 
12.10.2022
Одобрена: 
21.03.2023
Принята к публикации: 
24.03.2023

Вы здесь

Главная